中国医药产业经过一轮较长时间的持续高速成长后，影响行业良性发展的各种矛盾逐渐显露出来，其中市场竞争与行业监管的矛盾、市场经济与医院垄断的矛盾、健康产业与贿赂经济的矛盾、老百姓看病难、看病贵的矛盾等尤为突出。
第一终端现状及发展趋势
二甲以上医院为主导的医院仍是中国药品分销的主渠道，2008年，中国19701家医院的药品销售总量约为3025亿元（占成品药销售额的60%），其中约2800家大型医院的占比就达80%。其中第一终端（医院）市场为国内外大型药企的主要品种，集中度较高，在全国的医院销售中，销售领先的20家企业所占的份额合计为28.8%。外企在医院销售的绝对值和增长均较高。内资企业上榜的有：山东齐鲁、江苏恒瑞、哈药集团、扬子江、北京双鹭、上海新先锋和海南通用三洋7家，在前20家领先企业中销售占比仅为28.32%。第一终端已被外资及国内大型医药企业所占领。
由于公立医院的改革还处于试点和摸索期，故未来几年内第一终端的主流展地位仍将牢不可破，并将持续稳定、高速增长（或大于产业平均增速），只是其中的县级医院的占比可能会有更多的拉动。
第二终端现状与发展趋势
城市的零售与连锁药店占全国药品总体销量的26%，全国零售药店总数已达36.7万家，中国现有连锁零售企业1986家，占全国总门店数的34.96%，连锁经营仍有较大的发展空间，2008年药品零售市场销售规模约为1300亿元，同比增长约18.2%。连锁百强的分店总数达43945家，占全国的12%；连锁百强销售额572亿元，占全国的44%。但随着新医改政策的颁布，第二终端市场的规模走向目前还难以推测。
国家政策导向：“零售药店全部配备基本药物”+“患者凭处方可以到零售药店购买基本药”，基本药物制度的推广下，零售药店是否也实行“零差率”配送？是否能够在基层医疗机构得以坚决贯彻，目前政策还不是十分确切。
第三终端现状与发展趋势
第三终端基层医疗机构销售占全年药品销售的14%，未来的发展趋势第三终端增量明显，市场总趋势看好，但由于基本药物制度的实施需要一定的磨合，其中基本药物制度在2010年对第三终端正面拉动较大。但总的趋势是新医改将极大地扩容。
